Systématique en microbiologie. Notion d'espèce. Classification mixte consensuelle en bactériologie.


7. Bibliographie et sitographie (liens vérifiés 09/2017).

• L'article taxinomie de Wikipedia présente bien ce concept : http://fr.wikipedia.org/wiki/Taxinomie(09/2017).

• Remerciements à J.P. Euzéby pour les réponses apportées à mes questions.
• http://www.bacterio.net/ (09/2017) Le site créé en 1997 par Euzéby. INCONTOURNABLE !!!
• Le code phylogénique de nomenclature du vivant est consultable à https://www.ohiou.edu/phylocode (09/2017). Pour amateurs de règlements...

Pour naviguer dans la classification du vivant ...

•  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy (09/2017) (navigation dans toute la classification avec tous les liens vers les bases de données "entrez" !)
• Toujours pour naviguer dans l'arbre du vivant : http://tolweb.org/tree/ (09/2017).

Kenneth Todar de l'University of Wisconsin Department of Bacteriology propose un excellent cours le" Todar's Online Textbook of Bacteriology" à http://textbookofbacteriology.net :

• http://textbookofbacteriology.net/procaryotes.html (09/2017).

Pour ceux qui voudraient commencer à comprendre les techniques et les problèmes liés à la construction des arbres phylogéniques

•  http://www.info.univ-angers.fr/~gh/Idas/Wphylog/infobiogen/phylogenie.htm (09/2017).
•  Au sujet des horloges moléculaires : médecine sciences ; Volume 22, numéro 4, avril 2006, p. 374-380 téléchargeable à http://www.erudit.org/revue/ms/2006/v22/n4/012809ar.html (09/2017) .
•  Introduction à la construction d'arbres phylogéniques à http://bioinfo-fr.net/les-arbres-phylogeniques-construction-et-interpretation (09/2017).
•  Un mémoire de Master de l'univversité de Montréal comparant le séquençage des gènes ARNr 16S et de 9 gènes de protéines pour construire des arbres phylogénétiques chez des γ-protéobactéries. Consultable à : http://www.archipel.uqam.ca/2795/1/M9566.pdf (09/2017).
•  Un article d'introduction aux horloges moleculaires, Emmanuel J P Douzery, Frederic Delsuc, Herve Philippe ; Les horloges moleculaires à l'heure de la genomique [Molecular dating in the genomic era] ; medecine/sciences, EDP Sciences, 2006, 22 (4), pp.374-80. Fichier pdf consultable à : https://hal.archives-ouvertes.fr/halsde-00315396/document (09/2017).
•  Un bon article comparant l'utilisation des gènes l'ARNr 16 et rpoB pour construire des arbres phylogénétiques. Use of 16S rRNA and rpoB Genes as Molecular Markers for Microbial Ecology Studies ; Rebecca J. Case, Yan Boucher, [...], and Staffan Kjelleberg ; AEM 2007, 73(1):278-288 téléchargeable à http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1797146/#!po=36.1111 (09/2017).


retour en haut de page