4. L'essentiel à retenir
Dans le cadre des cours et du travail des cours en ligne pour les étudiants du BTS biotechnologies, lycée St Louis de Bordeaux, ce paragraphe apparaîtra partiellement pour une première étape le
mardi 17/03 et sera complété pour une deuxième étape le jeudi 19/03.
Dans le programme du BTS biotechnologies, les techniques d'isoélectrofocalisation et d'électrophorèse 2D des protéines sont explicitement au programme. La protéomique n'est pas explicitement nommée
mais les applications en analyse de protéines par spectro. de masse sont nommées donc il faut connaître la définition du terme protéomique et être capable d'analyser un document scientifique
avec électrophorèses 2D pour étude de protéomique.
Principe de l'isoélectrofocalisation (IEF), l'essentiel :
- Le pH ou point isoionique d'une protéine est _____________________________________________________________
- On peut créer un gradient de _______ _________ au sein d'un gel de polyacrylamide entre les 2 compartiments du tampon au pôle positif (tampon acide) et du tampon au pôle négatif (tampon alcalin).
- Dans un tel système, toute protéine échantillon ira se __________ dans son lieu de ______________.
- L'IEF est une électrophorèse de zones à l'équilibre : une fois focalisée _______________________________________________________________________________________________.
Electrophorèse bidimensionnelle de protéines, l'essentiel :
- On travaille avec des échantillons de protéines dénaturées solubilisées.
- Dans une première phase on réalise une _________________________________.
- Le gel d'IEF est ensuite traité au ______________________ et appliqué contre un gel de type ____________________________________. Une migration électrophorétique est réalisée dans ce nouveau gel sous un champ
"perpendiculaire" à celui de l'IEF.
- On obtient après révélation des spots protéiques sur un plan (2D). Chaque spot correspond à _______________________________.
- La méthode peut être suffisamment résolutive pour prétendre individualiser toutes les unités protéiques d'un échantillons (il est très peu probable _____________________________________________________________________.
Voici
le lien vers les réponses au texte "à trous" ci-dessous.
Protéomique, l'essentiel :
Contenu à venir dans le cadre d'une programmation en semaine 13 !
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Pour comprendre par l'exemple, se rendre à :
http://www.seed-proteome.com/index.php?rub=Seed_germination_proteins_2
Un bon exemple, un peu plus ancien à :
http://www.ibgc.u-bordeaux2.fr/YPM/carte.htm
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