Microorganismes et respirations
Définition(s)
Le terme de respiration est utilisé pour qualifier le métabolisme énergétique des organismes vivants chimiotrophes qui régénèrent l'ATP à partir de l'ADP plus phosphate en utilisant le système en 3 phases suivant :
Le nutriment énergétique (donneur d'électrons) est oxydé et des coenzymes transporteurs d'électrons sont réduits.
Les coenzymes réduits vont être finalement réoxydés contre un accepteur terminal d'électrons (l'accepteur terminal des électrons = un oxydant comme le dioxygène ou les nitrates, ...) par l'intermédiaire d'un ensemble de réactions catalysées en partie ou en totalité par des protéines membranaires dont certaines de nature cytochromique. Cet ensemble de protéines membranaires est appelé chaîne respiratoire. la réoxydation des coenzymes réduits est couplée à la translocation unidirectionnelle de protons à travers la membrane : elle conduit à la formation d'un gradient électrochimique membranaire (gradient protonmoteur).
Le gradient protonmoteur permet finalement la régénération d'ATP à partir d'ADP plus phosphate via les protéines ATPsynthases membranaires.
Le mécanisme global des phases 2 et 3 qui couple finalement la réoxydations des coenzymes transporteurs d'électrons à la régénération d'ATP est appelé phosphorylation oxydative
Note : la définition proposée ci-dessus n'est qu'une définition. Les microorganismes "n'ont rien à faire" des définitions des humains. Si on veut qualifier le métabolisme énergétique de chaque microorganisme à l'aide de l'une des 4 appellations fermentation ou respiration ou phototrophie ou méthanogénèse et de ces 4 appellations seulement, on va vers des débats infinis ... Il faut savoir rester ouvert devant la diversité du vivant et des adaptations aux différents environnements qu'il propose.