Milieux sélectifs

Au sens du dictionnaire (Larousse), sélectionner c'est "choisir, dans un ensemble, les éléments qui répondent le mieux à un critère donné".

De façon très générale et en dehors de tout contexte, tout milieu de culture, dans des conditions de culture donnée (température, aération ou pas, durée de l'incubation ...) exerce une pression de sélection : on n'y cultivera que ce qui peut y cultiver.

Le terme milieu sélectif est utilisé en microbiologie pour qualifier un milieu de culture destiné à sélectionner les micro-organismes recherchés et eux seulement au sein d'un échantillon poly-microbien, dans un contexte donné. La sélection sera réalisée par le fait que le milieu sélectif devra permettre la croissance des micro-organismes recherchés et tuer ou interdire la croissance des non recherchés présents dans l'échantillon. Ainsi le terme milieu sélectif désigne très généralement un milieu auquel on a rajouté un agent chimique inhibant ou défavorisant la culture de micro-organismes qui sinon cultiveraient sur le milieu dans le contexte de l'échantillon étudié.

Notes importantes. Le caractère sélectif au sens le plus large du terme d'un milieu de culture ne dépend pas que de l'apport ou pas d'un agent chimique inhibiteur sélectif : une culture en milieu aéré sélectionne les micro-organismes aérobies ou anaérobies aérotolérants, une culture en jarre anaérobie sélectionne les anaérobies stricts ou aérotolérants ou anaérobies facultatifs, une culture à 50°C sélectionne des thermophiles, une culture dans un milieu dépourvu de métabolites essentiels sélectionne des souches prototrophes, une culture sur un milieu synthétique avec une source de carbone et d'énergie unique et très particulière sélectionne les micro-organnismes capables de l'assimiler... Il convient donc de regarder attentivement le contexte pour comprendre l'utilisation qui peut être faite du terme milieu sélectif dans la littérature microbiologique. Une fois de plus on a à faire avec un terme aux contours un peu flous...

Un milieu sélectif peut évidemment se présenter sous forme solide (agarosé) ou liquide (bouillon).

Milieux d'enrichissement

Les milieux sélectifs liquides sont souvent qualifiés de milieux d'enrichissement. En effet, à partir d'un échantillon mis à cultiver dans un milieu d'enrichissement, on va pouvoir élever fortement jusqu'à la rendre majoritaire la population des germes ciblés de l'échantillon au détriment des autres. Même si les micro-organismes ciblés étaient très minoritaires au départ dans l'échantillon. Ceci permettra alors d'isoler des micro-organismes correspondant à ceux ciblés.

Milieux différentiels

Un milieu différentiel (on dit aussi indicateur) permet de distinguer différents groupes de micro-organismes qui cultivent sur un milieu en mettant en évidence (ou pas) un caractère phénotypique biochimique particulier. Cette mise en évidence est visuelle et concerne l'apparence des colonies ou du milieu juste autour.

Milieux sélectifs et différentiels

Un milieu à la fois sélectif et différentiel ...


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